Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarce1O54941 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarce1O54941 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarce1O54941 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarce1O54941 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarce1O54941 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarce1O54941 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarce1O54941 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarce1O54941 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarce1O54941 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarce1O54941 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Smarce1O54941 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Smarce1O54941 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Smarce1O54941 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Smarce1O54941 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Smarce1O54941 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarce1O54941 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smarce1O54941 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Smarce1O54941 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarce1O54941 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarce1O54941 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarce1O54941 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarce1O54941 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarce1O54941 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms