Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DffaO54786 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DffaO54786 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DffaO54786 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DffaO54786 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DffaO54786 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DffaO54786 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DffaO54786 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DffaO54786 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DffaO54786 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DffaO54786 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DffaO54786 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DffaO54786 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DffaO54786 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DffaO54786 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DffaO54786 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DffaO54786 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DffaO54786 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DffaO54786 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DffaO54786 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DffaO54786 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DffaO54786 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DffaO54786 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DffaO54786 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DffaO54786 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DffaO54786 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DffaO54786 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DffaO54786 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DffaO54786 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DffaO54786 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DffaO54786 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DffaO54786 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DffaO54786 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DffaO54786 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DffaO54786 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DffaO54786 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DffaO54786 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DffaO54786 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DffaO54786 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DffaO54786 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DffaO54786 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DffaO54786 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DffaO54786 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DffaO54786 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DffaO54786 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DffaO54786 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DffaO54786 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DffaO54786 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DffaO54786 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DffaO54786 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DffaO54786 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DffaO54786 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DffaO54786 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DffaO54786 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DffaO54786 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DffaO54786 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DffaO54786 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DffaO54786 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DffaO54786 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DffaO54786 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DffaO54786 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DffaO54786 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DffaO54786 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DffaO54786 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DffaO54786 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DffaO54786 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DffaO54786 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DffaO54786 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DffaO54786 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DffaO54786 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DffaO54786 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DffaO54786 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DffaO54786 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DffaO54786 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DffaO54786 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DffaO54786 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DffaO54786 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DffaO54786 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DffaO54786 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DffaO54786 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DffaO54786 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DffaO54786 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DffaO54786 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DffaO54786 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DffaO54786 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DffaO54786 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DffaO54786 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DffaO54786 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DffaO54786 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DffaO54786 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DffaO54786 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DffaO54786 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DffaO54786 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DffaO54786 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DffaO54786 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DffaO54786 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DffaO54786 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DffaO54786 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DffaO54786 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DffaO54786 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms