Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LANCL1O43813 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LANCL1O43813 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LANCL1O43813 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LANCL1O43813 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LANCL1O43813 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LANCL1O43813 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LANCL1O43813 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LANCL1O43813 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LANCL1O43813 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LANCL1O43813 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LANCL1O43813 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LANCL1O43813 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LANCL1O43813 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms