Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BUD23O43709 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BUD23O43709 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BUD23O43709 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BUD23O43709 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BUD23O43709 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BUD23O43709 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BUD23O43709 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BUD23O43709 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BUD23O43709 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BUD23O43709 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BUD23O43709 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BUD23O43709 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BUD23O43709 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BUD23O43709 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BUD23O43709 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BUD23O43709 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BUD23O43709 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BUD23O43709 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BUD23O43709 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BUD23O43709 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BUD23O43709 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BUD23O43709 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BUD23O43709 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BUD23O43709 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BUD23O43709 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BUD23O43709 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BUD23O43709 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BUD23O43709 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BUD23O43709 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BUD23O43709 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BUD23O43709 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BUD23O43709 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BUD23O43709 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BUD23O43709 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BUD23O43709 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BUD23O43709 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BUD23O43709 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BUD23O43709 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BUD23O43709 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BUD23O43709 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BUD23O43709 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BUD23O43709 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BUD23O43709 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BUD23O43709 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BUD23O43709 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BUD23O43709 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BUD23O43709 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BUD23O43709 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BUD23O43709 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BUD23O43709 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BUD23O43709 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BUD23O43709 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BUD23O43709 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BUD23O43709 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BUD23O43709 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BUD23O43709 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BUD23O43709 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BUD23O43709 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BUD23O43709 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BUD23O43709 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BUD23O43709 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BUD23O43709 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BUD23O43709 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BUD23O43709 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BUD23O43709 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BUD23O43709 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BUD23O43709 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BUD23O43709 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BUD23O43709 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BUD23O43709 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BUD23O43709 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BUD23O43709 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BUD23O43709 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BUD23O43709 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BUD23O43709 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BUD23O43709 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BUD23O43709 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BUD23O43709 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BUD23O43709 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BUD23O43709 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BUD23O43709 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BUD23O43709 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BUD23O43709 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BUD23O43709 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BUD23O43709 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BUD23O43709 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BUD23O43709 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BUD23O43709 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BUD23O43709 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BUD23O43709 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BUD23O43709 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BUD23O43709 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BUD23O43709 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BUD23O43709 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BUD23O43709 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BUD23O43709 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BUD23O43709 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BUD23O43709 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BUD23O43709 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms