Protein–RNA interactions for Protein: O43676

NDUFB3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB3O43676 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB3O43676 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB3O43676 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFB3O43676 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFB3O43676 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFB3O43676 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB3O43676 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFB3O43676 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms