Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLF4O43474 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLF4O43474 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLF4O43474 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLF4O43474 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLF4O43474 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLF4O43474 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLF4O43474 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLF4O43474 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLF4O43474 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLF4O43474 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLF4O43474 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLF4O43474 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLF4O43474 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLF4O43474 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLF4O43474 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLF4O43474 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLF4O43474 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLF4O43474 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLF4O43474 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLF4O43474 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLF4O43474 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLF4O43474 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLF4O43474 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLF4O43474 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLF4O43474 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLF4O43474 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLF4O43474 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLF4O43474 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLF4O43474 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF4O43474 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF4O43474 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF4O43474 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF4O43474 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLF4O43474 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLF4O43474 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLF4O43474 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF4O43474 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF4O43474 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLF4O43474 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLF4O43474 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLF4O43474 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF4O43474 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF4O43474 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF4O43474 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLF4O43474 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF4O43474 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF4O43474 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF4O43474 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF4O43474 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF4O43474 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF4O43474 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF4O43474 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF4O43474 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF4O43474 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF4O43474 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF4O43474 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF4O43474 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF4O43474 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF4O43474 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF4O43474 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLF4O43474 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF4O43474 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF4O43474 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF4O43474 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF4O43474 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLF4O43474 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLF4O43474 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLF4O43474 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLF4O43474 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLF4O43474 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF4O43474 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLF4O43474 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF4O43474 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLF4O43474 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF4O43474 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLF4O43474 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF4O43474 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF4O43474 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLF4O43474 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF4O43474 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF4O43474 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLF4O43474 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLF4O43474 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF4O43474 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF4O43474 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF4O43474 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLF4O43474 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF4O43474 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF4O43474 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF4O43474 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF4O43474 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLF4O43474 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLF4O43474 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF4O43474 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLF4O43474 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLF4O43474 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KLF4O43474 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLF4O43474 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLF4O43474 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms