Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRID2O43424 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GRID2O43424 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRID2O43424 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRID2O43424 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRID2O43424 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRID2O43424 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRID2O43424 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRID2O43424 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRID2O43424 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRID2O43424 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRID2O43424 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRID2O43424 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRID2O43424 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRID2O43424 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRID2O43424 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRID2O43424 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRID2O43424 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRID2O43424 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRID2O43424 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRID2O43424 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRID2O43424 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRID2O43424 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRID2O43424 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRID2O43424 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRID2O43424 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRID2O43424 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRID2O43424 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRID2O43424 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRID2O43424 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRID2O43424 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRID2O43424 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRID2O43424 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRID2O43424 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRID2O43424 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRID2O43424 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRID2O43424 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRID2O43424 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRID2O43424 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRID2O43424 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRID2O43424 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRID2O43424 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRID2O43424 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRID2O43424 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRID2O43424 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GRID2O43424 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRID2O43424 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRID2O43424 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRID2O43424 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRID2O43424 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRID2O43424 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRID2O43424 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GRID2O43424 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRID2O43424 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRID2O43424 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRID2O43424 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRID2O43424 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRID2O43424 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRID2O43424 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRID2O43424 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRID2O43424 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRID2O43424 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRID2O43424 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRID2O43424 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRID2O43424 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRID2O43424 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRID2O43424 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRID2O43424 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRID2O43424 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GRID2O43424 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRID2O43424 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRID2O43424 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRID2O43424 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRID2O43424 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRID2O43424 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRID2O43424 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRID2O43424 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRID2O43424 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRID2O43424 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRID2O43424 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRID2O43424 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRID2O43424 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRID2O43424 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRID2O43424 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRID2O43424 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRID2O43424 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRID2O43424 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRID2O43424 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRID2O43424 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRID2O43424 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRID2O43424 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GRID2O43424 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRID2O43424 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRID2O43424 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRID2O43424 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRID2O43424 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRID2O43424 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRID2O43424 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRID2O43424 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRID2O43424 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms