Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHHO43323 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHHO43323 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHHO43323 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHHO43323 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHHO43323 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHHO43323 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHHO43323 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHHO43323 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHHO43323 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHHO43323 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHHO43323 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DHHO43323 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DHHO43323 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DHHO43323 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DHHO43323 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DHHO43323 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DHHO43323 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DHHO43323 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DHHO43323 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DHHO43323 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DHHO43323 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DHHO43323 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DHHO43323 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DHHO43323 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DHHO43323 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DHHO43323 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DHHO43323 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DHHO43323 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHHO43323 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHHO43323 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHHO43323 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHHO43323 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHHO43323 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHHO43323 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DHHO43323 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DHHO43323 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DHHO43323 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DHHO43323 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DHHO43323 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DHHO43323 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHHO43323 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHHO43323 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHHO43323 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DHHO43323 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DHHO43323 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DHHO43323 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DHHO43323 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHHO43323 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHHO43323 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DHHO43323 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHHO43323 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHHO43323 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHHO43323 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHHO43323 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHHO43323 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DHHO43323 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DHHO43323 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHHO43323 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHHO43323 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHHO43323 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHHO43323 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHHO43323 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHHO43323 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHHO43323 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DHHO43323 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHHO43323 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHHO43323 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHHO43323 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHHO43323 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHHO43323 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHHO43323 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHHO43323 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DHHO43323 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHHO43323 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHHO43323 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHHO43323 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHHO43323 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHHO43323 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHHO43323 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHHO43323 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHHO43323 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHHO43323 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHHO43323 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHHO43323 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHHO43323 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHHO43323 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHHO43323 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHHO43323 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHHO43323 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHHO43323 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHHO43323 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHHO43323 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHHO43323 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHHO43323 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHHO43323 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHHO43323 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHHO43323 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHHO43323 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHHO43323 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms