Protein–RNA interactions for Protein: O43291

SPINT2, Kunitz-type protease inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT2O43291 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPINT2O43291 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINT2O43291 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPINT2O43291 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPINT2O43291 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINT2O43291 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINT2O43291 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPINT2O43291 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT2O43291 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT2O43291 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPINT2O43291 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINT2O43291 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPINT2O43291 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT2O43291 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT2O43291 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINT2O43291 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINT2O43291 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT2O43291 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT2O43291 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT2O43291 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms