Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnih2O35089 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih2O35089 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih2O35089 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih2O35089 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih2O35089 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnih2O35089 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnih2O35089 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms