Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHADO15335 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHADO15335 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHADO15335 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHADO15335 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHADO15335 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHADO15335 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHADO15335 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHADO15335 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHADO15335 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHADO15335 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHADO15335 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHADO15335 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHADO15335 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHADO15335 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHADO15335 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHADO15335 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHADO15335 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHADO15335 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHADO15335 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHADO15335 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHADO15335 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHADO15335 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHADO15335 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHADO15335 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHADO15335 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHADO15335 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHADO15335 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHADO15335 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHADO15335 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHADO15335 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHADO15335 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHADO15335 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHADO15335 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHADO15335 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHADO15335 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHADO15335 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHADO15335 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHADO15335 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHADO15335 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHADO15335 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHADO15335 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHADO15335 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHADO15335 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHADO15335 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHADO15335 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHADO15335 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHADO15335 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHADO15335 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHADO15335 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHADO15335 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHADO15335 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHADO15335 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHADO15335 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHADO15335 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHADO15335 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHADO15335 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHADO15335 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHADO15335 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHADO15335 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHADO15335 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHADO15335 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHADO15335 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHADO15335 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHADO15335 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHADO15335 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHADO15335 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHADO15335 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHADO15335 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHADO15335 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHADO15335 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHADO15335 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHADO15335 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHADO15335 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHADO15335 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHADO15335 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHADO15335 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHADO15335 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHADO15335 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CHADO15335 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHADO15335 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHADO15335 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHADO15335 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHADO15335 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHADO15335 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHADO15335 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHADO15335 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHADO15335 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHADO15335 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHADO15335 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHADO15335 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHADO15335 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHADO15335 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHADO15335 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHADO15335 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHADO15335 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHADO15335 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHADO15335 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHADO15335 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHADO15335 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms