Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A1O15245 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A1O15245 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A1O15245 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A1O15245 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC22A1O15245 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC22A1O15245 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC22A1O15245 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC22A1O15245 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms