Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCLK1O15075 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCLK1O15075 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCLK1O15075 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCLK1O15075 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCLK1O15075 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DCLK1O15075 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCLK1O15075 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DCLK1O15075 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCLK1O15075 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCLK1O15075 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DCLK1O15075 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCLK1O15075 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCLK1O15075 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DCLK1O15075 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCLK1O15075 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms