Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASKO14936 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASKO14936 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKO14936 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKO14936 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASKO14936 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKO14936 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASKO14936 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASKO14936 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASKO14936 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKO14936 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASKO14936 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASKO14936 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASKO14936 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKO14936 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKO14936 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASKO14936 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASKO14936 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASKO14936 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKO14936 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASKO14936 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKO14936 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKO14936 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKO14936 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKO14936 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASKO14936 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKO14936 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKO14936 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASKO14936 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKO14936 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASKO14936 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKO14936 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKO14936 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASKO14936 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKO14936 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKO14936 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKO14936 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKO14936 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKO14936 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASKO14936 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASKO14936 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASKO14936 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKO14936 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKO14936 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASKO14936 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASKO14936 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKO14936 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKO14936 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKO14936 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASKO14936 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKO14936 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKO14936 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASKO14936 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASKO14936 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKO14936 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKO14936 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKO14936 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASKO14936 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKO14936 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKO14936 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKO14936 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASKO14936 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKO14936 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASKO14936 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKO14936 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKO14936 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASKO14936 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASKO14936 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASKO14936 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASKO14936 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKO14936 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKO14936 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKO14936 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKO14936 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASKO14936 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKO14936 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKO14936 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKO14936 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKO14936 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKO14936 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKO14936 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKO14936 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKO14936 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKO14936 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKO14936 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKO14936 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKO14936 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKO14936 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKO14936 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKO14936 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKO14936 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKO14936 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKO14936 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKO14936 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKO14936 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKO14936 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKO14936 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKO14936 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKO14936 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKO14936 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms