Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GIPC1O14908 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GIPC1O14908 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GIPC1O14908 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GIPC1O14908 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GIPC1O14908 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GIPC1O14908 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms