Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FFAR3O14843 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FFAR3O14843 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FFAR3O14843 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FFAR3O14843 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FFAR3O14843 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FFAR3O14843 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FFAR3O14843 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FFAR3O14843 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FFAR3O14843 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms