Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NDC80O14777 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NDC80O14777 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NDC80O14777 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NDC80O14777 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NDC80O14777 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NDC80O14777 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NDC80O14777 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDC80O14777 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDC80O14777 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NDC80O14777 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NDC80O14777 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NDC80O14777 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NDC80O14777 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NDC80O14777 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NDC80O14777 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NDC80O14777 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NDC80O14777 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDC80O14777 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDC80O14777 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDC80O14777 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NDC80O14777 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDC80O14777 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDC80O14777 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDC80O14777 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDC80O14777 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDC80O14777 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NDC80O14777 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDC80O14777 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDC80O14777 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDC80O14777 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDC80O14777 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NDC80O14777 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDC80O14777 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDC80O14777 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDC80O14777 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDC80O14777 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDC80O14777 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDC80O14777 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDC80O14777 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDC80O14777 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDC80O14777 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDC80O14777 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NDC80O14777 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDC80O14777 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDC80O14777 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDC80O14777 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDC80O14777 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDC80O14777 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDC80O14777 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDC80O14777 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDC80O14777 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDC80O14777 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDC80O14777 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NDC80O14777 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDC80O14777 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NDC80O14777 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NDC80O14777 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDC80O14777 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDC80O14777 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDC80O14777 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDC80O14777 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NDC80O14777 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NDC80O14777 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDC80O14777 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDC80O14777 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDC80O14777 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDC80O14777 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NDC80O14777 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDC80O14777 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDC80O14777 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDC80O14777 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDC80O14777 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDC80O14777 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDC80O14777 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDC80O14777 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDC80O14777 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDC80O14777 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDC80O14777 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDC80O14777 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDC80O14777 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDC80O14777 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDC80O14777 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDC80O14777 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDC80O14777 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDC80O14777 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDC80O14777 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDC80O14777 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDC80O14777 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDC80O14777 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDC80O14777 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDC80O14777 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NDC80O14777 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDC80O14777 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDC80O14777 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDC80O14777 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDC80O14777 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDC80O14777 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDC80O14777 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDC80O14777 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms