Protein–RNA interactions for Protein: O14640

DVL1, Segment polarity protein dishevelled homolog DVL-1, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DVL1O14640 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DVL1O14640 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DVL1O14640 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DVL1O14640 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DVL1O14640 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DVL1O14640 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DVL1O14640 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DVL1O14640 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DVL1O14640 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DVL1O14640 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DVL1O14640 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DVL1O14640 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DVL1O14640 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DVL1O14640 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DVL1O14640 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DVL1O14640 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DVL1O14640 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DVL1O14640 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DVL1O14640 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DVL1O14640 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DVL1O14640 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DVL1O14640 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DVL1O14640 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DVL1O14640 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DVL1O14640 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DVL1O14640 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DVL1O14640 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DVL1O14640 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DVL1O14640 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DVL1O14640 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DVL1O14640 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DVL1O14640 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DVL1O14640 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DVL1O14640 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DVL1O14640 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DVL1O14640 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DVL1O14640 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DVL1O14640 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DVL1O14640 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DVL1O14640 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DVL1O14640 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DVL1O14640 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DVL1O14640 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DVL1O14640 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DVL1O14640 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DVL1O14640 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DVL1O14640 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DVL1O14640 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DVL1O14640 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DVL1O14640 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DVL1O14640 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DVL1O14640 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DVL1O14640 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DVL1O14640 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DVL1O14640 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DVL1O14640 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DVL1O14640 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DVL1O14640 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DVL1O14640 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DVL1O14640 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DVL1O14640 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DVL1O14640 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DVL1O14640 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DVL1O14640 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DVL1O14640 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DVL1O14640 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DVL1O14640 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DVL1O14640 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DVL1O14640 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DVL1O14640 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DVL1O14640 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DVL1O14640 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DVL1O14640 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DVL1O14640 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DVL1O14640 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DVL1O14640 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DVL1O14640 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DVL1O14640 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DVL1O14640 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DVL1O14640 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DVL1O14640 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DVL1O14640 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DVL1O14640 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DVL1O14640 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DVL1O14640 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DVL1O14640 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DVL1O14640 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DVL1O14640 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DVL1O14640 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DVL1O14640 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DVL1O14640 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DVL1O14640 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DVL1O14640 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DVL1O14640 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DVL1O14640 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DVL1O14640 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DVL1O14640 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DVL1O14640 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DVL1O14640 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DVL1O14640 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms