Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPEO14579 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COPEO14579 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COPEO14579 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPEO14579 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPEO14579 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPEO14579 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPEO14579 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPEO14579 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPEO14579 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPEO14579 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPEO14579 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPEO14579 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPEO14579 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPEO14579 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPEO14579 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPEO14579 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPEO14579 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPEO14579 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COPEO14579 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPEO14579 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPEO14579 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPEO14579 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPEO14579 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPEO14579 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPEO14579 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPEO14579 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPEO14579 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPEO14579 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPEO14579 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPEO14579 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPEO14579 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPEO14579 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPEO14579 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPEO14579 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPEO14579 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPEO14579 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPEO14579 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPEO14579 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPEO14579 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPEO14579 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPEO14579 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPEO14579 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPEO14579 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPEO14579 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPEO14579 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPEO14579 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPEO14579 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COPEO14579 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPEO14579 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPEO14579 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPEO14579 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPEO14579 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPEO14579 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPEO14579 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPEO14579 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPEO14579 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COPEO14579 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPEO14579 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPEO14579 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COPEO14579 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPEO14579 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPEO14579 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPEO14579 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPEO14579 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPEO14579 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPEO14579 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPEO14579 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPEO14579 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPEO14579 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPEO14579 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPEO14579 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPEO14579 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPEO14579 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPEO14579 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPEO14579 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPEO14579 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPEO14579 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COPEO14579 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COPEO14579 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPEO14579 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPEO14579 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COPEO14579 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPEO14579 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPEO14579 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPEO14579 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPEO14579 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPEO14579 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPEO14579 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPEO14579 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPEO14579 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPEO14579 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPEO14579 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPEO14579 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPEO14579 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPEO14579 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPEO14579 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPEO14579 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPEO14579 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPEO14579 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms