Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PbsnO08976 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PbsnO08976 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PbsnO08976 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PbsnO08976 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PbsnO08976 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PbsnO08976 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PbsnO08976 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PbsnO08976 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PbsnO08976 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PbsnO08976 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PbsnO08976 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PbsnO08976 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PbsnO08976 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PbsnO08976 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PbsnO08976 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PbsnO08976 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PbsnO08976 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PbsnO08976 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PbsnO08976 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PbsnO08976 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PbsnO08976 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PbsnO08976 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms