Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F3O00716 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F3O00716 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F3O00716 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F3O00716 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F3O00716 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F3O00716 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F3O00716 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F3O00716 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F3O00716 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F3O00716 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F3O00716 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F3O00716 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F3O00716 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F3O00716 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F3O00716 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F3O00716 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F3O00716 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F3O00716 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F3O00716 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F3O00716 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F3O00716 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F3O00716 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F3O00716 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2F3O00716 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F3O00716 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F3O00716 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F3O00716 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F3O00716 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F3O00716 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F3O00716 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F3O00716 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F3O00716 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F3O00716 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F3O00716 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F3O00716 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F3O00716 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F3O00716 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F3O00716 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F3O00716 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F3O00716 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F3O00716 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F3O00716 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F3O00716 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F3O00716 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F3O00716 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F3O00716 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F3O00716 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F3O00716 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F3O00716 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F3O00716 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F3O00716 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F3O00716 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F3O00716 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F3O00716 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F3O00716 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F3O00716 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F3O00716 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F3O00716 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F3O00716 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F3O00716 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F3O00716 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F3O00716 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F3O00716 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F3O00716 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F3O00716 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F3O00716 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F3O00716 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F3O00716 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F3O00716 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F3O00716 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F3O00716 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F3O00716 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
E2F3O00716 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F3O00716 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F3O00716 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F3O00716 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F3O00716 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F3O00716 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F3O00716 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F3O00716 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F3O00716 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F3O00716 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F3O00716 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F3O00716 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F3O00716 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F3O00716 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F3O00716 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F3O00716 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F3O00716 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F3O00716 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F3O00716 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F3O00716 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
E2F3O00716 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F3O00716 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F3O00716 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F3O00716 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F3O00716 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F3O00716 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F3O00716 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms