Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF4O00268 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF4O00268 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF4O00268 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF4O00268 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF4O00268 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF4O00268 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF4O00268 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF4O00268 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF4O00268 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF4O00268 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF4O00268 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF4O00268 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF4O00268 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF4O00268 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF4O00268 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF4O00268 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF4O00268 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF4O00268 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF4O00268 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF4O00268 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF4O00268 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF4O00268 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF4O00268 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF4O00268 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TAF4O00268 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF4O00268 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF4O00268 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4O00268 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4O00268 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF4O00268 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF4O00268 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF4O00268 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF4O00268 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF4O00268 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF4O00268 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4O00268 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF4O00268 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF4O00268 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF4O00268 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF4O00268 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4O00268 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4O00268 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4O00268 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4O00268 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4O00268 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4O00268 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4O00268 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4O00268 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4O00268 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4O00268 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4O00268 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF4O00268 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF4O00268 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF4O00268 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF4O00268 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF4O00268 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF4O00268 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF4O00268 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF4O00268 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF4O00268 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF4O00268 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF4O00268 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF4O00268 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF4O00268 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF4O00268 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF4O00268 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4O00268 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4O00268 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4O00268 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF4O00268 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF4O00268 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF4O00268 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4O00268 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4O00268 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF4O00268 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF4O00268 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4O00268 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF4O00268 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4O00268 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4O00268 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4O00268 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF4O00268 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4O00268 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF4O00268 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF4O00268 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF4O00268 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF4O00268 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF4O00268 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF4O00268 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF4O00268 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF4O00268 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF4O00268 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF4O00268 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF4O00268 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF4O00268 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF4O00268 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF4O00268 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF4O00268 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF4O00268 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms