Protein–RNA interactions for Protein: O00217

NDUFS8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS8O00217 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS8O00217 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS8O00217 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS8O00217 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS8O00217 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS8O00217 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS8O00217 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS8O00217 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFS8O00217 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFS8O00217 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS8O00217 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS8O00217 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFS8O00217 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms