Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVH48-1M5A8F1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVH48-1M5A8F1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVH48-1M5A8F1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVH48-1M5A8F1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVH48-1M5A8F1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVH48-1M5A8F1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVH48-1M5A8F1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVH48-1M5A8F1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVH48-1M5A8F1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVH48-1M5A8F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVH48-1M5A8F1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVH48-1M5A8F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVH48-1M5A8F1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms