Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20696H3BJN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20696H3BJN7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm20696H3BJN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20696H3BJN7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20696H3BJN7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20696H3BJN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20696H3BJN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20696H3BJN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20696H3BJN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms