Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox13F6YCR7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox13F6YCR7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhox13F6YCR7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhox13F6YCR7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox13F6YCR7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox13F6YCR7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox13F6YCR7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox13F6YCR7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox13F6YCR7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox13F6YCR7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox13F6YCR7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox13F6YCR7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox13F6YCR7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms