Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf165E9QAU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf165E9QAU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf165E9QAU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf165E9QAU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf165E9QAU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf165E9QAU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf165E9QAU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf165E9QAU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf165E9QAU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf165E9QAU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf165E9QAU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf165E9QAU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf165E9QAU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf165E9QAU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf165E9QAU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf165E9QAU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf165E9QAU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf165E9QAU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf165E9QAU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf165E9QAU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf165E9QAU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf165E9QAU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms