Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzd7E9Q9W7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzd7E9Q9W7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd7E9Q9W7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd7E9Q9W7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzd7E9Q9W7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzd7E9Q9W7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdzd7E9Q9W7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzd7E9Q9W7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzd7E9Q9W7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdzd7E9Q9W7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd7E9Q9W7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd7E9Q9W7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd7E9Q9W7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzd7E9Q9W7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzd7E9Q9W7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd7E9Q9W7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd7E9Q9W7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd7E9Q9W7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd7E9Q9W7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdzd7E9Q9W7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzd7E9Q9W7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms