Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc121E9Q6D3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc121E9Q6D3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc121E9Q6D3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc121E9Q6D3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc121E9Q6D3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc121E9Q6D3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc121E9Q6D3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc121E9Q6D3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc121E9Q6D3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc121E9Q6D3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc121E9Q6D3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc121E9Q6D3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc121E9Q6D3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc121E9Q6D3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc121E9Q6D3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc121E9Q6D3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc121E9Q6D3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms