Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ19

Igsf9b, Protein turtle homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9bE9PZ19 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Igsf9bE9PZ19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Igsf9bE9PZ19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Igsf9bE9PZ19 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Igsf9bE9PZ19 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Igsf9bE9PZ19 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Igsf9bE9PZ19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Igsf9bE9PZ19 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Igsf9bE9PZ19 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Igsf9bE9PZ19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Igsf9bE9PZ19 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Igsf9bE9PZ19 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Igsf9bE9PZ19 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Igsf9bE9PZ19 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Igsf9bE9PZ19 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Igsf9bE9PZ19 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Igsf9bE9PZ19 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Igsf9bE9PZ19 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Igsf9bE9PZ19 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Igsf9bE9PZ19 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Igsf9bE9PZ19 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Igsf9bE9PZ19 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Igsf9bE9PZ19 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Igsf9bE9PZ19 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Igsf9bE9PZ19 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Igsf9bE9PZ19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Igsf9bE9PZ19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Igsf9bE9PZ19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Igsf9bE9PZ19 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Igsf9bE9PZ19 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Igsf9bE9PZ19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Igsf9bE9PZ19 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Igsf9bE9PZ19 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Igsf9bE9PZ19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Igsf9bE9PZ19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Igsf9bE9PZ19 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Igsf9bE9PZ19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Igsf9bE9PZ19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Igsf9bE9PZ19 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Igsf9bE9PZ19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Igsf9bE9PZ19 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Igsf9bE9PZ19 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Igsf9bE9PZ19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Igsf9bE9PZ19 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Igsf9bE9PZ19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Igsf9bE9PZ19 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Igsf9bE9PZ19 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Igsf9bE9PZ19 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Igsf9bE9PZ19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Igsf9bE9PZ19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms