Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms