Protein–RNA interactions for Protein: D3YZI9

Pgbd5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd5D3YZI9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pgbd5D3YZI9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pgbd5D3YZI9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pgbd5D3YZI9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pgbd5D3YZI9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pgbd5D3YZI9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pgbd5D3YZI9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgbd5D3YZI9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgbd5D3YZI9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pgbd5D3YZI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pgbd5D3YZI9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pgbd5D3YZI9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pgbd5D3YZI9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pgbd5D3YZI9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pgbd5D3YZI9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pgbd5D3YZI9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pgbd5D3YZI9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pgbd5D3YZI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pgbd5D3YZI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pgbd5D3YZI9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pgbd5D3YZI9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgbd5D3YZI9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgbd5D3YZI9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgbd5D3YZI9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pgbd5D3YZI9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pgbd5D3YZI9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms