Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc170D3YXL0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc170D3YXL0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc170D3YXL0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc170D3YXL0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc170D3YXL0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc170D3YXL0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc170D3YXL0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc170D3YXL0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc170D3YXL0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc170D3YXL0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms