Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam47eD3YWC7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam47eD3YWC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam47eD3YWC7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam47eD3YWC7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam47eD3YWC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam47eD3YWC7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam47eD3YWC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam47eD3YWC7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam47eD3YWC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam47eD3YWC7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam47eD3YWC7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam47eD3YWC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam47eD3YWC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam47eD3YWC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam47eD3YWC7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam47eD3YWC7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam47eD3YWC7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam47eD3YWC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam47eD3YWC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam47eD3YWC7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam47eD3YWC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam47eD3YWC7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam47eD3YWC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam47eD3YWC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam47eD3YWC7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam47eD3YWC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam47eD3YWC7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam47eD3YWC7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam47eD3YWC7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam47eD3YWC7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam47eD3YWC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms