Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRBOX1C9JBD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRBOX1C9JBD0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRBOX1C9JBD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRBOX1C9JBD0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRBOX1C9JBD0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355.9 ms