Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA8B8ZZ34 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA8B8ZZ34 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA8B8ZZ34 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA8B8ZZ34 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA8B8ZZ34 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA8B8ZZ34 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA8B8ZZ34 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA8B8ZZ34 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA8B8ZZ34 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA8B8ZZ34 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHISA8B8ZZ34 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHISA8B8ZZ34 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SHISA8B8ZZ34 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms