Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cspp1B2RX88 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cspp1B2RX88 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cspp1B2RX88 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cspp1B2RX88 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cspp1B2RX88 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cspp1B2RX88 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cspp1B2RX88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cspp1B2RX88 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cspp1B2RX88 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cspp1B2RX88 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cspp1B2RX88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cspp1B2RX88 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cspp1B2RX88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cspp1B2RX88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cspp1B2RX88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cspp1B2RX88 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cspp1B2RX88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cspp1B2RX88 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cspp1B2RX88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cspp1B2RX88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cspp1B2RX88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cspp1B2RX88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cspp1B2RX88 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cspp1B2RX88 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms