Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cfap58B2RW38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cfap58B2RW38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cfap58B2RW38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cfap58B2RW38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap58B2RW38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap58B2RW38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap58B2RW38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap58B2RW38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap58B2RW38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap58B2RW38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap58B2RW38 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cfap58B2RW38 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap58B2RW38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap58B2RW38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap58B2RW38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cfap58B2RW38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap58B2RW38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cfap58B2RW38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms