Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700018F24RikB2RW27 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700018F24RikB2RW27 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700018F24RikB2RW27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700018F24RikB2RW27 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700018F24RikB2RW27 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700018F24RikB2RW27 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700018F24RikB2RW27 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700018F24RikB2RW27 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700018F24RikB2RW27 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700018F24RikB2RW27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700018F24RikB2RW27 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
1700018F24RikB2RW27 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700018F24RikB2RW27 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700018F24RikB2RW27 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700018F24RikB2RW27 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700018F24RikB2RW27 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
1700018F24RikB2RW27 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
1700018F24RikB2RW27 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700018F24RikB2RW27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700018F24RikB2RW27 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700018F24RikB2RW27 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700018F24RikB2RW27 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700018F24RikB2RW27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
1700018F24RikB2RW27 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700018F24RikB2RW27 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700018F24RikB2RW27 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
1700018F24RikB2RW27 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700018F24RikB2RW27 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700018F24RikB2RW27 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms