Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Mbd5B1AYB6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Mbd5B1AYB6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Mbd5B1AYB6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Mbd5B1AYB6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Mbd5B1AYB6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Mbd5B1AYB6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Mbd5B1AYB6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Mbd5B1AYB6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Mbd5B1AYB6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Mbd5B1AYB6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Mbd5B1AYB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Mbd5B1AYB6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Mbd5B1AYB6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Mbd5B1AYB6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Mbd5B1AYB6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Mbd5B1AYB6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Mbd5B1AYB6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Mbd5B1AYB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Mbd5B1AYB6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Mbd5B1AYB6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Mbd5B1AYB6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Mbd5B1AYB6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Mbd5B1AYB6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Mbd5B1AYB6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Mbd5B1AYB6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Mbd5B1AYB6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Mbd5B1AYB6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Mbd5B1AYB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Mbd5B1AYB6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Mbd5B1AYB6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Mbd5B1AYB6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Mbd5B1AYB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Mbd5B1AYB6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Mbd5B1AYB6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Mbd5B1AYB6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Mbd5B1AYB6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Mbd5B1AYB6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Mbd5B1AYB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Mbd5B1AYB6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Mbd5B1AYB6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Mbd5B1AYB6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Mbd5B1AYB6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Mbd5B1AYB6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Mbd5B1AYB6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Mbd5B1AYB6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Mbd5B1AYB6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Mbd5B1AYB6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Mbd5B1AYB6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Mbd5B1AYB6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Mbd5B1AYB6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Mbd5B1AYB6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Mbd5B1AYB6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Mbd5B1AYB6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Mbd5B1AYB6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Mbd5B1AYB6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Mbd5B1AYB6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Mbd5B1AYB6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Mbd5B1AYB6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Mbd5B1AYB6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Mbd5B1AYB6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Mbd5B1AYB6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Mbd5B1AYB6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Mbd5B1AYB6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Mbd5B1AYB6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Mbd5B1AYB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Mbd5B1AYB6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Mbd5B1AYB6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Mbd5B1AYB6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Mbd5B1AYB6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Mbd5B1AYB6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Mbd5B1AYB6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Mbd5B1AYB6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Mbd5B1AYB6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Mbd5B1AYB6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Mbd5B1AYB6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms