Protein–RNA interactions for Protein: A8MVW0

FAM171A2, Protein FAM171A2, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM171A2A8MVW0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM171A2A8MVW0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM171A2A8MVW0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM171A2A8MVW0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM171A2A8MVW0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM171A2A8MVW0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM171A2A8MVW0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM171A2A8MVW0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM171A2A8MVW0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM171A2A8MVW0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms