Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CD8B2A6NJW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD8B2A6NJW9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD8B2A6NJW9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD8B2A6NJW9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD8B2A6NJW9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD8B2A6NJW9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD8B2A6NJW9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD8B2A6NJW9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms