Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX3A6NHT5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX3A6NHT5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX3A6NHT5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMX3A6NHT5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMX3A6NHT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms