Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRBA1A5PL33 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRBA1A5PL33 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRBA1A5PL33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KRBA1A5PL33 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRBA1A5PL33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRBA1A5PL33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KRBA1A5PL33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRBA1A5PL33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRBA1A5PL33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRBA1A5PL33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRBA1A5PL33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRBA1A5PL33 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRBA1A5PL33 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRBA1A5PL33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRBA1A5PL33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRBA1A5PL33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRBA1A5PL33 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KRBA1A5PL33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRBA1A5PL33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRBA1A5PL33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRBA1A5PL33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms