Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
EFCAB5A4FU69 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
EFCAB5A4FU69 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
EFCAB5A4FU69 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
EFCAB5A4FU69 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
EFCAB5A4FU69 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
EFCAB5A4FU69 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
EFCAB5A4FU69 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
EFCAB5A4FU69 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
EFCAB5A4FU69 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.58
EFCAB5A4FU69 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
EFCAB5A4FU69 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
EFCAB5A4FU69 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
EFCAB5A4FU69 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
EFCAB5A4FU69 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
EFCAB5A4FU69 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
EFCAB5A4FU69 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
EFCAB5A4FU69 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
EFCAB5A4FU69 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.42■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
EFCAB5A4FU69 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
EFCAB5A4FU69 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
EFCAB5A4FU69 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
EFCAB5A4FU69 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
EFCAB5A4FU69 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
EFCAB5A4FU69 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
EFCAB5A4FU69 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
EFCAB5A4FU69 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
EFCAB5A4FU69 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
EFCAB5A4FU69 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
EFCAB5A4FU69 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
EFCAB5A4FU69 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
EFCAB5A4FU69 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
EFCAB5A4FU69 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.26■■■■■ 4.52
EFCAB5A4FU69 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
EFCAB5A4FU69 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
EFCAB5A4FU69 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
EFCAB5A4FU69 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms