Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htra4A2RT60 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htra4A2RT60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Htra4A2RT60 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Htra4A2RT60 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Htra4A2RT60 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htra4A2RT60 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htra4A2RT60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htra4A2RT60 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms