Protein–RNA interactions for Protein: A2RRY9

4930595M18Rik, RIKEN cDNA 4930595M18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595M18RikA2RRY9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930595M18RikA2RRY9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930595M18RikA2RRY9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930595M18RikA2RRY9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
4930595M18RikA2RRY9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930595M18RikA2RRY9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930595M18RikA2RRY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4930595M18RikA2RRY9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930595M18RikA2RRY9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930595M18RikA2RRY9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
4930595M18RikA2RRY9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930595M18RikA2RRY9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930595M18RikA2RRY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930595M18RikA2RRY9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms