Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC78A2IDD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC78A2IDD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC78A2IDD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC78A2IDD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC78A2IDD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC78A2IDD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC78A2IDD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC78A2IDD5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC78A2IDD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC78A2IDD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC78A2IDD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC78A2IDD5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC78A2IDD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC78A2IDD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC78A2IDD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC78A2IDD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC78A2IDD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC78A2IDD5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC78A2IDD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC78A2IDD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms