Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39aA2ACP1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc39aA2ACP1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39aA2ACP1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39aA2ACP1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39aA2ACP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc39aA2ACP1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc39aA2ACP1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc39aA2ACP1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc39aA2ACP1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc39aA2ACP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc39aA2ACP1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc39aA2ACP1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc39aA2ACP1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc39aA2ACP1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc39aA2ACP1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc39aA2ACP1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc39aA2ACP1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc39aA2ACP1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc39aA2ACP1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc39aA2ACP1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms