Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sh3pxd2bA2AAY5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sh3pxd2bA2AAY5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3pxd2bA2AAY5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3pxd2bA2AAY5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3pxd2bA2AAY5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3pxd2bA2AAY5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3pxd2bA2AAY5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3pxd2bA2AAY5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3pxd2bA2AAY5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3pxd2bA2AAY5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3pxd2bA2AAY5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3pxd2bA2AAY5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms